きっかけはわからないのですが、 IntelliJ IDEA Ultimate (2016.2) でPythonのプロジェクトを開いたとき、
localのPython（具体的にはvirtualenvで作ったグローバルでないPython環境）のモジュールが読み込めなくなるという
困った事態に陥っていました。
pip でインストールしたモジュールだけでなく sys も os も読み込めないし、range() のような標準関数も認識してくれない。

たぶん これ と同じ症状。

うちのあるぱかも PyCharm Professional (2016.3) で同じ症状になってこまっていました。

… これ かな？

というわけで ここ から
utrunner.py をダウンロードして次のファイルを置き換えたら無事モジュールを読み込めるようになったので
めでたしめでたし、というお話。

IntelliJ IDEA Ultimate (2016.2) OSX版
~/Library/Application Support/IntelliJIdea2016.2/python/helpers/pycharm/utrunner.py

PyCharm Professional (2016.3) OSX版
/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pycharm/utrunner.py

いつかまた同じトラブルに見舞われたときのために備忘として。